Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms