Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer2Q9QWW1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms