Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdcQ9QW08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms