Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms