Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dkk3Q9QUN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms