Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slamf1Q9QUM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms