Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln8Q9QUK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms