Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2bQ9JME9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2bQ9JME9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms