Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms