Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp5Q9JLK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp5Q9JLK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms