Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LitafQ9JLJ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms