Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Tgm1Q9JLF6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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Tgm1Q9JLF6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tgm1Q9JLF6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms