Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms