Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms