Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3m1Q9JKC8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms