Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msgn1Q9JK54 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms