Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip3Q9JJR9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms