Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efcc1Q9JJF6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms