Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcb9Q9JJ59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcb9Q9JJ59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms