Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms