Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb1Q9JIF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms