Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim54Q9ERP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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