Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef4Q9EQZ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms