Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnn1Q9EQR3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnn1Q9EQR3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms