Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf21Q9EPU5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms