Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp2Q9EPK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms