Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r54Q9EPB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r54Q9EPB8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r54Q9EPB8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms