Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r53Q9EP93 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms