Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndufa8Q9DCJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufa8Q9DCJ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms