Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GabarapQ9DCD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabarapQ9DCD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GabarapQ9DCD6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms