Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms