Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms