Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ftsj3Q9DBE9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms