Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fundc1Q9DB70 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms