Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s2Q9DB50 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap1s2Q9DB50 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms