Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhobtb1Q9DAK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb1Q9DAK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms