Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf7Q9DAG9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms