Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms