Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9S1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9S1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms