Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D9D9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms