Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmco5aQ9D9D5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco5aQ9D9D5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmco5aQ9D9D5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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