Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlirpQ9D8T7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms