Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rexo2Q9D8S4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo2Q9D8S4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo2Q9D8S4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms