Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl4Q9D8E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms