Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms