Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn9Q9D805 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms