Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2dQ9D7M8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2dQ9D7M8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms