Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4cQ9D7F7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms