Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap3Q9D706 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms