Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs6Q9D6W8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Borcs6Q9D6W8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Borcs6Q9D6W8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms